于杨课题组 · 交互可视化

Interactive Visualization for Teaching & Research
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课题组制作的交互可视化合集

作品均可在浏览器中直接打开,支持电脑与手机端。3D 场景可拖拽旋转、滚轮缩放,点击场景中的元素查看机制详解。建议使用 Chrome / Edge / Safari 最新版访问。

基础医学

Basic Medicine 0 个作品
PPARα · 线粒体 · 脂滴 · ROS

脓毒症肝细胞脂代谢紊乱

3D Mechanism · Sepsis & Lipid Metabolism

八阶段动态演示脓毒症时肝细胞内脂代谢的崩塌过程:脂肪分解、FFA 摄取、线粒体损伤、脂滴堆积直至细胞死亡,实时指标联动,基于 Guo Y et al., 2025。

3D 机制脓毒症文献驱动
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ODE · Michaelis-Menten · 10 参数实时调节

LipoKinetics 脂蛋白代谢模拟

Kinetics Simulation · Lipoprotein Metabolism

基于 ODE 与 Michaelis-Menten 动力学的脂蛋白代谢实时模拟:调节 LPL、CETP 等 10 项酶活性参数,观察 CM/VLDL/IDL/LDL/HDL 各池动态演化,支持文献导入自动调参与参数链接分享。

动力学模拟脂蛋白可调参数
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I II III IV ATP H+H+H+

线粒体电子传递链 3D

3D Mechanism · Mitochondrial ETC

交互式三维呈现呼吸链复合体 I-IV 与 ATP 合酶的电子传递、质子泵送与 ATP 合成;可旋转缩放观察内膜结构与能量转换,适配《生物化学》教学。

3D 机制线粒体生物化学
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投资期 · 耗能 产能期 · 产能 −ATP −ATP +ATP +NADH Glucose → 2 Pyruvate · 十步酶促反应三维还原

糖酵解途径 · 十步反应 3D

3D Mechanism · Glycolysis Pathway

三维还原葡萄糖到丙酮酸的十步酶促反应:碳流沿空间曲线流动,可切换物种、设置酶抑制剂观察代谢断点,投资期与产能期的 ATP / NADH 收支一目了然,适配《生物化学》教学。

3D 机制糖代谢生物化学
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葡萄糖醛酸途径 · Glucuronate pathway HK1 PGM1 UGP2 UGDH AKR1A1 GULO 有 GULO · 合成维生素 C 鼠 · 兔 · 牛 · 猪 · 犬 · 鸟 无 GULO · 通路卡断 人 · 豚鼠 · 灵长类 · 蝙蝠 六个酶均为真实蛋白结构 · GULO 为限速酶

维生素 C 合成通路 · GULO 缺失

3D Mechanism · Vitamin C Biosynthesis · GULO

三维还原葡萄糖醛酸途径合成维生素 C 的六步酶促反应,六个酶均采用真实蛋白结构。可切换「有 / 无 GULO 物种」:有 GULO 者通路贯通生成抗坏血酸;人类、豚鼠、灵长类与蝙蝠因 GULO 假基因化,通路在限速酶处卡断,只能从日粮摄取,适配《生物化学》教学。

3D 机制维生素代谢比较进化
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迪医视角

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